Biji kopi, semasa pemprosesan industri, juga boleh digunakan untuk pengeluaran kopi tanpa kafein. Proses ini, dipanggil decaffeination, berlaku apabila benih masih hijau dan tidak selepas memanggang. Banyak kaedah boleh digunakan untuk menghilangkan kafein dari kopi, tetapi semua termasuk rendaman benih hijau dalam air panas (proses yang dikenali sebagai proses air Switzerland) atau wap; pada ketika ini, pelarut ditambahkan yang membubarkan dan memisahkan minyak yang mengandungi kafein dari benih. Kafein sering digunakan oleh pemproses kopi yang, sebagai sumber pendapatan tambahan, menjual kafein kepada syarikat-syarikat farmaseutikal.
