Keasaman kuat kandungan gastrik menjadikan perut persekitaran yang sangat bermusuhan untuk virus dan bakteria. Hanya satu spesies, Helicobacter pylori, dapat mengatasi survival dan koloni mukosa perut manusia. Untuk selebihnya, kebanyakan mikroorganisma yang ditelan dengan cepat dimusnahkan dalam masa beberapa minit.
Beberapa kajian in vitro menunjukkan bahawa, untuk tindakan bakterisida yang luas dan berkesan, pH mesti sangat rendah. Khususnya, pH yang bersamaan dengan atau kurang daripada 2.0 secara amnya membunuh semua bakteria; Walau bagaimanapun, keasaman yang sama terdapat di dalam perut hanya dalam keadaan puasa, sedangkan setelah makan kehadiran makanan (kenderaan utama yang bakteria menembus perut) sementara menaikkan pH ke nilai 4-5.
Ia juga perlu untuk mempertimbangkan faktor masa, kerana pH yang lebih rendah dan masa yang lebih sedikit diperlukan untuk mendapatkan tindakan bakterisida yang lengkap, dan sebaliknya. Walau bagaimanapun, nilai pH di atas 3.5 mempunyai kesan bakteria yang sangat rendah, sementara pH di atas 4 mempunyai kesan bakteris sifar.
Bukti saintifik terkini menunjukkan bagaimana aktiviti bakteria ditentukan - sebagai tambahan kepada keasidan gastrik - juga oleh pepsin (enzim proteolitik yang terlibat dalam pencernaan protein). Aktiviti antibiotik tertentu juga diberikan oleh enzim tertentu yang terdapat dalam jus gastrik, seperti defensin dan lactoferrin.
Di hadapan mikrob, kelangsungan hidup pelbagai mikroorganisma terhadap aktiviti bakterisida jus gastrik dapat disukai oleh hubungan dengan beberapa unsur makanan; Sebagai contoh, telah menunjukkan bahawa virulensi salmonella jelas unggul apabila ia dimasukkan ke dalam saluran pencernaan dengan makanan protein (contohnya telur atau daging) yang tercemar.
Jelasnya, walaupun penggunaan ubat antacid atau inhibitor pam proton, menurunkan pH gastrik, menggalakkan bakteria hidup di dalam perut. Tambahan pula, apabila beban bakteria (bilangan bakteria ditelan) meningkat, kemungkinan bahawa beberapa mikroorganisma akan bertahan juga akan meningkat.
Masalah toksin dan spora juga perlu dipertimbangkan. Toksin adalah bahan yang dihasilkan oleh bakteria atau konstituen mereka, yang boleh menyebabkan kerosakan (keracunan makanan) walaupun bakteria terbunuh oleh keasidan lambung. Spora adalah sebaliknya bentuk senyap di mana beberapa bakteria berundur apabila keadaan alam sekitar tidak menguntungkan, hanya untuk diaktifkan semula sebaik sahaja keadaan membenarkan; spora Clostridium difficile, misalnya, melebihi keasidan lambung utuh dan kemudian bercambah di dalam perut.
Berbanding dengan bakteria, virus umumnya mempunyai peluang yang lebih besar untuk bertahan dalam persekitaran asid perut. Tidak menghairankan, virus yang dimiliki oleh generik Norovirus (Norwalk virus), Rotavirus, Astrovirus dan Adenovirus sering terlibat dalam bentuk bentuk cirit-birit yang menular (gastroenteritis virus).
