Bau najis terutamanya dikaitkan dengan proses putrefaktif yang mempengaruhi asid amino yang telah melepaskan penyerapan usus. Nutrien ini sebenarnya dipintas oleh bakteria usus, menjalani proses decarboxylation yang menghasilkan amina toksik yang berikut:
arginine → agmatine
cystine dan cysteine → mercaptan
histidine → histamine
lysine → cadaverine
ornithine → putrescine
tyrosine → tiratina
tryptophan → indole dan scatol
Banyak bahan-bahan ini memberikan najis bau yang tidak menyenangkan.
Cirit-birit dan najis vegetarian kurang berbau.
Fes dengan bau ikan atau sperma adalah ciri disentery bacillary, kolera dan lebih umum mucorrhea.
Ringkasnya, bau najis dipengaruhi oleh tabiat pemakanan (kuantiti protein, makanan aromatik seperti bawang putih atau bawang dan sebagainya), flora bakteria usus, keadaan kesihatan dan tabiat tertentu (seperti merokok atau mengunyah tembakau) . Secara umum, penggunaan makanan yang kecil dan seimbang, tanpa mengaitkan kuantiti penting makanan "tidak serasi" (lihat diet berpisah), membantu mengoptimumkan proses penghadaman, mengurangkan kejadian gangguan seperti meteorisme dan kembung, dan memberi najis bau sui generis.
Setiap kes di mana bau buruk najis disertai dengan gejala seperti hitam, najis atau najis pucat, kehadiran darah di dalamnya, demam, menggigil, kekejangan abdomen yang kuat, lendir yang banyak di dalam najis dan berat badan.